原料不同。硅表面活性剂和非硅表面活性剂是两种不同类型的表面活性剂，硅表面活性剂主要是以硅油为基础成分配制而成。但非硅的主要成分是醇类、脂肪酸类复合体。其实两者的消泡力差别并不大。
与水的溶解能力不同，由于硅表面活性剂采用硅油为原料，硅油对各类物质的不溶性，故不能与水或极性物质溶解。有硅表面活性剂，水和油面都可以消泡。
非硅系表面活性剂，PH范围3-14，适用于含水系的泡沫，少量的添加发挥出色的消泡效果，很好地防止泡沫的再生。
用途不同。表面活性剂用于食品、医疗、药品和化妆品。但是，容易形成硅点。但是，活性高，表面张力低，消泡力强。
非硅系表面活性剂适用于接线板、铝加工各种金素加工、各种污水处理及各种工业等水系消泡、冷却循环水电站等水处理系消泡，更具有碱性、制泡性。消泡性能略有下降，但使用范围扩大。